Le Département de l’aménagement du territoire a rejoint début 2008 la Mission opérationnelle transfrontalière (MOT) qui est un centre de compétences français dans le domaine de la politique de coopération transfrontalière.
Au cours de l’année 2016, la MOT a fourni un appui technique au DATer dans le cadre du développement de l’outil juridique visant à surmonter les obstacles transfrontaliers.
Le DATer participe également au comité stratégique transfrontalier sur l’observation qui s’est réuni à deux reprises au cours de l’année 2016.